一、试剂介绍

我们来详细解析 BTQ-2 Amidite。这是一个高度专业化、用于固相合成化学的修饰性亚磷酰胺单体，专为在寡核苷酸链中引入BTQ-2这一特定功能模块而设计。

核心概念：一种在DNA/RNA合成仪上使用的“功能化核苷酸砖块”，用于在寡核苷酸序列的任意指定位置，精确、共价地嵌入BTQ-2分子。

整体分子结构与合成位置

结构示意：

BTQ-2-染料 — (柔性连接臂，如C6或PEG链) — 修饰位点 — 5‘-O-亚磷酰胺（带DMT保护）

修饰位点：通常连接在脱氧尿苷的C5位或脱氧腺苷的N6位，通过一个稳定的炔键或三键连接，确保染料在DNA双螺旋中精确定向。

连接臂：一个烷基链或短PEG链，将BTQ-2与核苷酸骨架隔开，防止庞大的染料分子干扰DNA的杂交能力和双螺旋结构，这对保持寡核苷酸功能至关重要。

在DNA合成中的位置：

链内修饰：与 “BTQ-2 dT Linker Amidite” 类似，它允许将BTQ-2插入到寡核苷酸链的内部，而非仅末端。通过将其加入合成循环，可在序列的任何位置（通常是一个“T”或经过修饰的位点）引入该功能分子。

优势：

位点特异性与原子精度：可在长链中实现单一位点、确定化学结构的修饰。

结构均一性：化学合成确保每一条寡核苷酸链的修饰位点和数量完全相同。

保持生物功能：合理的连接臂设计使得修饰后的DNA仍能高效杂交，适用于基于序列识别的应用。

高性能光学特性：BTQ-2染料通常具有高亮度、光稳定性好等优点。

注意事项

合成成本：远高于普通核苷酸单体。

偶联效率：修饰性亚磷酰胺的偶联效率可能略低，需优化合成条件。

纯化必要性：必须进行高分辨率纯化以获得均一产物。

储存：对水和氧气极其敏感，需严格无水无氧保存。

总结

BTQ-2 Amidite 是合成生物学与化学基因组学领域的一件精密工具。它将先进的染料化学与自动化寡核苷酸合成技术无缝衔接，使研究人员能够像“编写程序”一样，在DNA/RNA分子的精确坐标上“安装”定制化的功能模块。

二、试剂属性

中文名称： 5'-黑洞淬灭剂-2亚磷酰胺

英文名称：BTQ-2 Amidite

Chemical Name: 4'-(4-Nitro-phenyldiazo)-2'-methoxy-5'-methoxy-azobenzene-4''-(N-ethyl)-N-ethyl-2-cyanoethyl-(N,N-diisopropyl)-phosphoramidite

Formula: C33H43N8O6P

Molecular Weight: 678.72

纯度：≥95%

外观：固体（dark purple solid）

品牌：陕西新研博美生物科技有限公司

溶解性：溶于部分有机溶剂以及水

储存条件：-20℃以下冰冻、干燥避光保存，避免反复冻融

规格：1mg，5mg，10mg

结构式：

三、相关试剂

MB 680R TFP Ester

MB 660R DBCO

MB 543 Alkyne

JOE phosphoramidite, 5-isomer

JOE NHS ester, 5-isomer

MB 543 DBCO

MB 543 Picolyl Azide

MB 543 DBCO

Difluorocarboxyfluorescein NHS Ester, 5-isomer

MB 594 Alkyne

JOE phosphoramidite, 6-isome

Difluorocarboxyfluorescein Azide, 6-isomer

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该试剂只用于科研实验，不能用于人体。